Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms