Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFR3BQ9Y2G0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFR3BQ9Y2G0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFR3BQ9Y2G0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms