Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUDCQ9Y266 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms