Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF3IP3Q9Y228 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP3Q9Y228 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP3Q9Y228 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms