Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HHLA3Q9XRX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms