Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN8AQ9UQD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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