Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms