Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP4E1Q9UPM8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4E1Q9UPM8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms