Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NOVA2Q9UNW9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOVA2Q9UNW9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206 ms