Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4EQ9ULY5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms