Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
INO80Q9ULG1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INO80Q9ULG1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms