Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA3Q9UL41 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms