Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SARDHQ9UL12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SARDHQ9UL12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms