Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ADAM28Q9UKQ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms