Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP8AP2Q9UKL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP8AP2Q9UKL3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP8AP2Q9UKL3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms