Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCP2D1Q9UJQ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms