Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms