Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms