Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGXB4Q9UGU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms