Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC17A7Q9P2U7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms