Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGFRNQ9P2B2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms