Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PHRF1Q9P1Y6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHRF1Q9P1Y6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms