Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMG20BQ9P0W2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMG20BQ9P0W2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMG20BQ9P0W2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms