Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms