Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDE1Q9NZC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDE1Q9NZC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDE1Q9NZC3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
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