Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms