Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIS18AQ9NYP9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIS18AQ9NYP9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms