Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms