Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53CQ9NYF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms