Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNAU1APQ9NX07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNAU1APQ9NX07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRNAU1APQ9NX07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNAU1APQ9NX07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNAU1APQ9NX07 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNAU1APQ9NX07 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms