Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC18Q9NUE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC18Q9NUE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms