Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GINM1Q9NU53 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms