Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGAP35Q9NRY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms