Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHPT1Q9NRX4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms