Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF3Q9NR23 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF3Q9NR23 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms