Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPHNQ9NQX3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms