Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XPNPEP3Q9NQH7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XPNPEP3Q9NQH7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms