Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLDQ9NQC7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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