Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED4Q9NPJ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED4Q9NPJ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED4Q9NPJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms