Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCFQ9NPI8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms