Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNB1IP1Q9NPC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms