Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSU72Q9NP77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSU72Q9NP77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms