Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNRD2Q9NNW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNRD2Q9NNW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms