Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK-5Q9HDB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-5Q9HDB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms