Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAT1LQ9HCJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms