Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCI7

MSL2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL2Q9HCI7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSL2Q9HCI7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms