Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRKRIP1Q9H875 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms