Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf33Q9H7E9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms