Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5orf42Q9H799 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms