Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCAD1Q9H4L7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms